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上海海事大学商船学院（Merchant marine college）成立于1995年4月，现设有航海系、轮机工程系、航运仿真技术教育部工程研究中心、航海科学研究所、中法联合伽利略系统与海上安全智能交通研究所、上海国际海事研究中心以及上海海事大学—挪威船级社国际合作中心。设航海技术、轮机工程、船舶电子电气、能源与动力工程4个本科专业，航海技术、轮机工程为国家级特色专业建设点和上海市本科教育高地。
拥有2个一级学科博士点（交通运输工程、船舶与海洋工程），4个二级学科博士点（交通信息工程及控制、载运工具运用工程、轮机工程、船舶与海洋结构物设计制造），3个一级学科硕士点（交通运输工程、船舶与海洋工程、动力工程及工程热物理），4个二级学科硕士点（交通信息工程及控制、载运工具运用工程、轮机工程、船舶与海洋结构物设计制造），5个工程类专业学位类别（交通运输、电子信息、机械、土木水利、能源动力），6个工程类专业学位领域（水路交通运输、人工智能、船舶工程、海洋工程、动力工程、清洁能源技术）。
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